要保存AE工程文件，可以按照以下步骤进行操作：1.在AE界面上方的菜单栏中选择“文件”，然后选择“保存”或者使用快捷键Ctrl+S/Command+S。此时，AE会将所有相关的项目文件、素材文件、效果等保存为一个.aep文件，这就是你的AE工程文件。务必保存好工程文件，以便在之后的编辑或导出过程中使用。
要保存AE（After Effects）工程文件，可以按照以下步骤进行操作：
1. 在AE界面上方的菜单栏中选择“文件（File）”，然后选择“保存（Save）”或者使用快捷键Ctrl + S（Windows）/ Command + S（Mac）。
2. 在弹出的文件保存对话框中，选择保存工程文件的位置，并为其命名，然后点击“保存”。
此时，AE会将所有相关的项目文件、素材文件、效果等保存为一个.aep文件，这就是你的AE工程文件。务必保存好工程文件，以便在之后的编辑或导出过程中使用。
需要注意的是，AE工程文件中不包含素材文件的实际内容，而是包含了它们在电脑上的路径。所以，在打开工程文件时，确保相关的素材文件仍然位于相同的路径下，以便AE能够正确加载它们。
希望以上信息对您有所帮助！